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Secuenciado el genoma de Arabidopsis

Cristina Junyent 20/12/00

Biomedia (Barcelona). Un consorcio internacional de científicos, formado en 1996 y en el que participan alrededor de 20 laboratorios europeos, ha publicado el genoma de Arabidopsis thaliana en la revista Nature (2000; 408: 791). La secuencia la firman 114 científicos de Francia, el Reino Unido, Alemania, Estados Unidos, Japón y España. Los grupos de investigación españoles que han intervenido en la secuenciación (concretamente del cromosoma 3 de la planta) son el equipo del profesor Manuel Pérez Alonso, director científico de Sistemas Genómicos, S.L. (empresa ubicada en el Parque Tecnológico de Valencia) y profesor de la Universidad de Valencia; y el equipo del profesor Pere Puigdomènech, del Instituto de Biología Molecular de Barcelona (CSIC). La secuenciación de los cromosomas 2 y 4 de esta planta ya había sido anunciada en 1999 (más información).

Arabidopsis es una crucífera, una planta anual de la familia de la mostaza o la coliflor. Es una planta útil para los científicos porque tiene un ciclo vital corto, madura rápidamente, es pequeña y produce una gran cantidad de semillas.

El número de pares de bases de Arabidopsis es de 119 millones, distribuidas en 5 cromosomas. El número de genes es de 26000, pero como gran parte de su genoma (el 80%) está duplicado o triplicado,  posiblemente, los que estructurarían la planta serían en torno a 15000. Un 8% concuerda con genes animales, mientras que un 20% es similar; los genes coincidentes son, sobre todo, los que tienen que ver con el metabolismo primario (síntesis de elementos básicos, como azúcares o grasas), los genes de funciones similares están relacionados con la formación del esqueleto (una mano, una hoja, un ala). Arabidopsis comparte genes funcionales (gemación, floración, letargia o formación de semillas) con otras plantas como el arroz, la soja, el trigo, el maíz y el algodón. A diferencia del genoma humano, en el de Arabidopsis hay muy poco DNA que no sea funcional, que no contenga genes. En la revista Science (2000; 290 [5499]: 2105-2114) se publican tres artículos sobre la genética comparativa de esta planta. Esta información ayudará a comprender los mecanismos de la evolución.

Las posibilidades que se abren tras la secuenciación del genoma de Arabidopsis son las que derivan de conseguir plantas con mayor resistencia al frío, que pueden mejorar la agricultura, o el conocimiento derivado del metabolismo secundario de las plantas, es decir, en producción industrial de fármacos, colorantes, fibras para tejidos, perfumes; también se podría conseguir producción de energía.

El de Arabidopsis es el primer genoma vegetal secuenciado, y es de dominio público; a partir de ahora, y durante los próximos diez años, la investigación se centrará en determinar la función de los 25000 genes de Arabidopsis.

Cristina Junyent es doctora en biología

Más información en Biomedia:
La larga aventura del genoma. Cristina Junyent (15/11/00)
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Análisis de los cromosomas de la planta Arabidopsis thaliana (26/04/00)
Descifrado el genoma de la mosca más conocida (29/03/00)

Más información en la red:
Arabidopsis: http://www.arabidopsis.org
Arabidopsis, grupos contribuyentes a la iniciativa del genoma de: http://www.nsf.gov/od/lpa/news/media/2000/agicontrib.htm
Nature: http://www.nature.com/genomics/
Science: http://www.sciencemag.org

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