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¿Qué genomas de mamífero deberían ser secuenciados?
| Carles Lalueza Fox | 9/11/01 |
Biomedia (Barcelona). La secuenciación del
genoma humano aportará información no sólo sobre los genes existentes en éste,
sino también sobre las bases genéticas de nuestro aspecto, desarrollo,
conductas y susceptibilidades a la enfermedad. La interpretación de estos datos
genéticos aportará indirectamente información sobre la organización del genoma
de otras especies próximas y sobre el origen de nuestros genes*. Para poder realizar esta aproximación de
genómica* comparada se requiere secuenciar
otros genomas de mamíferos. En un artículo aparecido en la revista Science
(Science 292, pp: 2264-2266), los
investigadores S.J. O´Brien, E. Sizirik y W.J. Murphy exponen diversos
criterios a tener en cuenta para seleccionar genomas de mamíferos
potencialmente interesantes. En primer lugar, hay entre
4600 y 4800 especies de mamíferos en el planeta, que según análisis
filogenéticos, se agrupan en 20 órdenes taxonómicos, de los cuales 18
corresponden a mamíferos placentarios (los otros dos incluyen los monotremas,
como el extraño ornitorrinco, y los marsupiales). Estos órdenes placentarios se
agrupan a su vez en 4 grandes clados*
filogenéticos; el primero incluye a animales como los elefantes y los manatíes,
el segundo a los perezosos y los armadillos, el tercero a los primates y los
roedores, y el cuarto a los carnívoros, insectívoros, murciélagos, cetáceos y
ungulados, entre otros. Hasta ahora, los tres genomas de mamífero secuenciados
o en proceso de serlo (el ser humano, el ratón y la rata), pertenecen a un
único clado (el tercero). Para los autores se trata de una coincidencia
desafortunada, puesto que seguiremos desconociendo cual es la estructura
genómica ancestral de los mamíferos y por tanto será más difícil poder
interpretar la organización genómica en un contexto evolutivo amplio. Por
ejemplo, en una escala menor, se ha sugerido que el genoma del macaco o incluso
del ratón, puede resultar más clarificador para entender las peculiaridades del
genoma humano que el de nuestro pariente más cercano, el chimpancé. Hay diversos factores a
considerar antes de seleccionar nuevas especies para secuenciar. Para los
autores, dependerá de si el organismo se emplea en investigación, de si tiene
importancia económica, del tamaño de su genoma y de la proximidad filogenética* a las especies ya secuenciadas. Teniendo en
cuenta estos factores y el árbol evolutivo de los mamíferos, las especies que
deberían seguir inmediatamente el camino de la secuenciación serían el cerdo,
la vaca, el perro y el gato (aunque ambos son carnívoros presentan marcadas
diferencias en cuanto a organización genómica); estas especies pertenecen al
clado número cuatro de los descritos anteriormente. Sin embargo, estos genomas
deberían complementarse con al menos un representante de cada uno de los otros
clados restantes, así como un marsupial y un monotrema. Sería también
interesante escoger mamíferos con organizaciones corporales primitivas y
estrategias de vida poco especializadas, porque esto podría indicar que su
genoma retiene el programa genético ancestral de los mamíferos.
Alternativamente, el genoma de especies muy especializadas y modificadas
morfológicamente, como los delfines o los murciélagos, proporcionaría
información sobre los cambios macroevolutivos que tuvieron lugar en el origen
de estos grupos. Bibliografía: * Glosario de Biomedia Más información en Biomedia: Más información en la red:
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