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Genómica funcional: primera inactivación genética de un organismo

Raimundo Roberts 31/01/03

Biomedia (Barcelona). Una vez más, el gusano Caenorhabditis elegans se ha convertido en protagonista de las investigaciones científicas en biología. En esta ocasión, científicos ingleses lo han utilizado como blanco en sus estudios sobre RNA interferente (RNAi*), logrando inactivar mediante este sistema más del ochenta por ciento de sus genes.

Como otros organismos utilizados como modelo en investigación, C. elegans comparte muchos de sus genes (en este caso, más de la mitad) con el ser humano y al desactivarlos es posible analizar las funciones que desempeñan no sólo en el organismo de estudio, sino también en el hombre. El trabajo, publicado en la revista Nature, lleva a la práctica la genómica funcional, es decir, la comprensión de la función de cada uno de los genes de un ser vivo, utilizando RNAi.

El gusano C. elegans tiene cerca de 19 000 genes, 12 000 menos que el ser humano. Usando RNAi, el grupo de Julie Ahringer, de la Universidad de Cambridge, Gran Bretaña, logró inactivar 16 757, es decir, más del 86 por ciento de los genes del nematodo.

Para llevar a cabo este trabajo, los investigadores sintetizaron trozos de RNA de doble cadena para cada gen conocido. Este RNA de doble cadena posee, entre otras características, la capacidad de adherirse funcionando como RNAi al RNA mensajero* e impedir que se sinteticen las proteínas para las que codifica. De este modo, los investigadores pueden anular la expresión de uno o varios genes de forma muy eficiente.

Para desarrollar esta investigación, se introdujeron RNA de doble cadena específicos para cada gen en más de 16 000 bacterias, que sirvieron de alimento a los gusanos. Las bacterias, de esta forma, sirvieron de «cápsulas» para introducir el RNAi en C. elegans.

A partir de los fenotipos de los gusanos resultantes, se pudo identificar la función de cerca del 10 por ciento de los genes, de los que sólo se conocía la tercera parte. Además, la información sobre los RNA utilizados está disponible en una biblioteca del RNAi del gusano, abierta a todos los investigadores en http://www.wormbase.org/.

Otros investigadores presentaron, en el mismo número de Nature, un estudio del genoma del C. elegans utilizando la base de datos del RNAi citada, con la que estudiaron las rutas metabólicas relacionadas con el desarrollo de la grasa. El grupo de Gary Ruvkun, de la Universidad de Harvard, identificó 305 genes que reducen la gordura y ciento doce «inactivaciones» que incrementan el almacenamiento de grasa. Muchos de estos genes codifican para receptores conocidos, canales de transporte y quinasas, posibles candidatos para el desarrollo de medicamentos.

Más información en Biomedia:
Caenorhabditis elegans: un gusano modelo
RNA de interferencia, el hito científico del 2002

Más información en la red:
«Genome-wide RNAi analysis of Caenorhabditis elegans fat regulatory genes», Nature 2003; 421:
268-272: http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nature/journal/v421/n6920/abs/nature01279_fs.html
«Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans genome using RNAi» Nature 2003; 421: 231-237: http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nature/journal/v421/n6920/abs/nature01278_fs.html
Instituto Británico de Biología del Desarrollo y Cáncer, de la Universidad de Cambridge, Wellcome Trust / Cancer Research UK Institute: http://www.welc.cam.ac.uk
Deparamento de Biología Molecular de la Universidad de Harvard: http://genetics.mgh.harvard.edu/PublicWeb/department/graduate.html
Página sobre la biología y el genoma de C. elegans: http://www.wormbase.org

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