Según los científicos, este genoma tiene una gran importancia para las investigaciones en genómica comparada, ya que su pequeño tamaño permite realizar comparaciones entre diferentes vertebrados, y «reconstruir los procesos evolutivos que llevaron a generar el genoma de los vertebrados superiores entre los cuales se encuentra el humano», explica Genís Parra, investigador del GRIB. El estudio, que fue dirigido por investigadores franceses y que contó con la colaboración de los expertos españoles y norteamericanos, se publica esta semana en la revista Nature.

Según han destacado los autores, su comparación con el genoma humano y otros genomas ha permitido arrojar pistas sobre 900 genes humanos de los que no se tenía información. Además, toda la información obtenida estará disponible de forma gratuita en las sedes web de las instituciones principales del proyecto, el Centro Nacional de Secuenciación Genoscope de Francia, y el Broad Institute del Massachusets Institute of Technology, en Estados Unidos.

Por su parte, el equipo de expertos del IMIM/UPF, dirigido por Roderic Guigó, ha participado en la secuenciación de la mayoría de los genomas más importantes hasta ahora realizadas, como el genoma humano, el del ratón, la rata y otros. Para ello han desarrollado herramientas informáticas de vanguardia que permiten visualizar genomas y predecir la ubicación de los genes entre los millones de combinaciones de letras que conforman un genoma.

Al comparar el genoma del pez globo con otros genomas se ha visto que el genoma de los peces ha divergido mucho más rápido que el de los mamíferos. Además, se han descubierto varios genes de importancia científica que no se sabía que existían en los peces.

La revista destaca que este estudio es un paso importante para la genómica comparada, ya que la mayoría de los genomas hasta ahora conocidos son de especies de experimentación o con importancia médica. El contar con dos especies de   vertebrados que tienen el genoma más pequeño conocido permitirá desarrollar nuevas estrategias de investigación y herramientas para conocer más sobre nuestro código genético.

El proyecto ENCODE

Por otra parte, la revista Science publica un número especial sobre los genes y sus funciones en el que se presenta el estudio ENCODE, considerado el paso siguiente en la investigación del genoma humano y en el que participa el grupo de Guigó, como único grupo español, junto a un grupo inglés y doce norteamericanos.

El estudio ENCODE tiene como objetivo crear un trabajo de referencia que ayude a explotar al máximo la información contenida en la secuencia del genoma humano, para así entender mejor la biología humana y desarrollar nuevas estrategias para prevenir y tratar enfermedades.

Los investigadores del IMIM estarán a cargo de uno de los 14 proyectos que conforman el estudio, y su trabajo será «llevar a cabo una anotación exhaustiva de los genes contemplados en el conjunto de regiones de DNA seleccionadas para el análisis (aproximadamente el 1% de todo el genoma humano), utilizando los programes informáticos que se han desarrollado en nuestro laboratorio», explicaron Robert Castelo y Genís Parra, investigadores del GRIB.

Más información en Biomedia:
Dossier: Genómica
El impacto mediático en la secuencia del genoma humano, Manuel Perucho (05/07/00)

Más información en la red:
Tetraodon nigroviridis. Centro Nacional de Secuenciación Genoscope: http://www.genoscope.cns.fr/externe/English/Projets/Projet_C/C.html
Tetraodon nigroviridis. Broad Institute, MIT: http://www.broad.mit.edu/annotation/tetraodon/
Nature: http://www.nature.com/
Science: http://www.sciencemag.org/
Grupo de Investigación en Informática Biomédica (GRIB) IMIM/UPF: http://www.imim.es/grib/

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